руппа появилась на свет в 1979 году близ Сан-Франциско. Основателями данной формации стали гитарист Кирк Хэмметт, ударник Том Хантинг, басист Карлтон Мелсон и вокалист Кит Стьюарт. Как утверждает Хэмметт, название он придумал по одноимённому роману Леона Юриса. Через некоторое время состав поменялся: бас-гитару взял Джэф Эндрюс, место гитариста занял гитарный техник Хэмметта Гэри Холт, а вокалистом стал Пол Бэйлофф, с которым Хэмметт познакомился на одной из вечеринок. В том же 1982 году, в обновленном составе Exodus записывают демо, ставшее единственным с участием Кирка Хэмметта. После записи 3-песенного демо основатель и гитарист группы Кирк Хэмметт покидает её в 1983 году, чтобы заменить уволенного Дэйва Мастейна в Metallica, который в свою очередь позже создает Megadeth. На смену ему приходит гитарист Рик Хунолт, в прошлом ученик известного музыканта-педагога Джо Сатриани, а басист Роб МакКиллоп заменил Эндрюса.
Группа записала свой первый альбом Bonded by Blood летом 1984 года. Студент звукорежиссёрского колледжа Марк Уитакер, который учился с Бэйлоффом в одной школе, на тот момент занимался менеджментом и записью группы. Первоначально названный «A Lesson In Violence», альбом был выпущен только в апреле 1985 года в связи с проблемами с лейблом Torrid, с которыми Exodus заключили контракт ещё в 1984 году. Вскоре после начала тура в поддержку дебютной пластинки, Пола Бэйлоффа увольняют из группы по причине «личных и музыкальных противоречий». Его заменяет Стив «Зэтро» Суза, до этого занимавший место фронтмена в Legacy, раннем воплощении Testament. После ухода Бэйлофф создал малоизвестный проект Piranha.
Состав Exodus с новым фронтменом оказался довольно стабильным на протяжение нескольких лет, и с ним были записаны несколько альбомов. Подпольный успех, достигнутый группой благодаря выходу Bonded by Blood, привёл группу к заключению контракта с Sony/Combat Records. Вскоре выходит новая работа группы — Pleasures of the Flesh, в которую вошли композиции, написанные ещё с Бэйлоффом, так и совершенно новые. Pleasures Of The Flesh показал группу с другой стороны — музыка стала более продуманной и утонченной, но потеряла в энергетике. Эта пластинка не смогла вернуть Exodus былой статус, но все же позволила как-то удержаться на плаву. Фортуна улыбнулась им только в апреле 1988 года, когда они получили возможность подписать контракт с крупной звукозаписывающей кампанией Capitol. Но, так как это означало новую тяжбу по расторжению контракта (на этот раз с Combat), участники группы приняли компромиссное решение — записать ещё один альбом для Combat, а потом перейти на Capitol Records. Fabulous Disaster, третья пластинка группы, была выпущена в январе 1989 года. Видеоклип на песню «The Toxic Waltz» тогда часто крутили на MTV. В середине 1989 года покидает группу основатель группы ударник Том Хантинг, ссылаясь на болезнь. Его заменяет Джон Темпеста, в прошлом техник Чарли Бенанте, барабанщика Anthrax. На волне успеха пластинки, в начале 1990 года Exodus заключают контракт с компанией Capitol Records, которая в следующем году выпускает четвертую работу группы Impact Is Imminent, в целом довольно посредственную и неспособную поддержать успех прошлого альбома. В 1991 году группа выпускает свой первый концертный альбом Good Friendly Violent Fun, записанный во время тура 1989 года.
После выхода Good Friendly Violent Fun группа в течение года дает единичные концерты. Майкл Батлер заменил МакКиллопа за бас-гитарой. В 1992 году Combat, стремясь «срубить» лёгких денег, выпускает сборник лучших вещей Exodus периода пребывания на лейбле, и в том же году выходит очередной альбом Force of Habit, кардинально отличающийся от прошлого творчества группы. Пластинка содержала множество медленных, «более тяжелых» песен с гораздо меньшим акцентом на скорость в отличие от старого материала. После обнародования Force Of Habit для Exodus наступают совсем тяжёлые времена — Джон Темпеста уходит к извечным конкурентам Testament (на короткое время его сменяет Крис Контос (экс-Machine Head, Testament). Не прилагая никаких усилий к продвижению Exodus, Capitol практически теряют интерес к группе. К этому прибавились личные проблемы и заботы (вроде рождения дочери Холта), и группа погрузилась в летаргический сон.
Гэри и Рик, совместно с бывшим вокалистом Two Bit Thief и Attitude по имени Энди Эндерсон, начинают сайд-проект Behemoth, тут же получивший предложение от Energy Records. Несколько лет Exodus не функционировали.
В 1997 году группа воссоединяется с оригинальным вокалистом — Полом Бэйлоффом и ударником Томом Хантингом. Место басиста занимает Джек Гибсон. Exodus дает серию концертов, один из которых был записан и выпущен в качестве концертного альбома независимой немецкой фирмой Century Media. Выход Another Lesson In Violence вновь подогрел интерес к группе, которая, собравшись с силами, стала готовить новый материал и играть концерты. Но вскоре возникают проблемы с Century Media: группа осталась недовольна продвижением концертного релиза, а также из-за неудачной попытки выпустить концерт на видео, который был записан, но так и не вышел в свет.
В 2001 году группа снова воссоединяется, чтобы выступить на Thrash of the Titans, благотворительном концерте, устроенном для сбора средств на лечение рака вокалиста Testament Чака Билли и Чака Шульдинера, лидера Death. На этот раз у группы есть четкая цель — выпустить новый студийный альбом, и Exodus с Полом Бэйлоффом за микрофонной стойкой продолжает давать концерты у себя в Сан-Франциско и ближайших городах. Однако, в феврале 2002 года происходит трагедия: Пол Бэйлофф переносит инсульт и умирает. Чтобы не сорвать концертные обязательства группа нанимает проверенного вокалиста — Стива «Зэтро» Сузу. Несмотря на смерть Бэйлоффа, Гэри Холт полон решимости записать новый альбом. Результатом явился выход в 2004 году Tempo of the Damned под эгидой немецкой Nuclear Blast Records. Работа была посвящена памяти Пола Бэйлоффа и вышла ровно во вторую годовщину его смерти — 2 февраля 2004 года. Это настоящий подарок поклонникам старой классики группы — Bonded by Blood, Pleasures of the Flesh и Fabulous Disaster. Но в то же время «Blacklist», «War is my Shepherd», «Shroud of Urine» станут настоящим наглядным уроком для молодого поколения трэшеров. Во время записи альбома произошла странная вещь: на альбоме должен был присутствовать трек «Crime of the Century», однако его запись исчезла при таинственных обстоятельствах. Песня рассказывала о временах, когда Exodus сотрудничала с Century Media (дочерней компанией которой являлась Nuclear Blast Records). Несмотря на то, что компания публично отрицала факт вмешательства, ходили слухи, что Century Media вынудили группу исключить песню из альбома. Её место в альбоме заняла песня «Impaler», написанная ещё в соавторстве с Кирком Хэмметтом, но впервые записанной в студии. Также этот трек присутствует на концертном альбоме Another Lesson In Violence. Возвращение группы состоялось на всех фронтах — Exodus возглавил осенний тур Bonded by Metal over Europe. Также был выпущен лимитированный сингл War is my Shepherd, который продавался только в ходе упомянутого тура и через почтовую рассылку Nuclear Blast. Помимо этого для композиции «War is my Shepherd» было снято видео. Второе видео — для композиции «Throwing Down».
В 2005 году Рик Ханолт решает покинуть состав группы и сосредоточиться на семейной жизни. Его заменяет гитарист из группы Heathen Ли Элтус. Том Хантинг также заявляет о своем уходе в связи с вновь проявившимися проблемами со здоровьем, заставившими его уйти из группы в прошлый раз. Место за ударными занимает Пол Бостаф, в прошлом игравший с Forbidden, Testament и Slayer. Стив Суза вновь покидает группу по причине финансовых разногласий с группой. Первое время его заменяет Стив Эскуивэл (ex-Defiance, Skinlab). В конце концов группа находит постоянного вокалиста в лице Роба Дьюкса.
Обновлённым на 60 % составом группа в 2005 году выпускает Shovel Headed Kill Machine. Тур в поддержку пластинки включал США, Европу, Японию, а также Австралию, где прежде группа ещё не выступала.
В марте 2007 года Том Хантинг снова возвращается в группу, и за этим последует запись очередной пластинки, получившей название The Atrocity Exhibition… Exhibit A. Летом 2008 года Exodus выступают на фестивале Wacken Open Air в Германии, а в апреле 2009 участвуют в совместном североамериканском туре с Kreator.
Кроме того, осенью 2008 года Exodus полностью перезаписывают дебютный Bonded by Blood и выпускают его под названием Let There Be Blood. Гэри Холт сделал официальное заявление по поводу решения группы перезаписать Bonded by Blood:" После многих лет планирования и дискуссий мы, наконец, закончили перезапись «Bonded by Blood». Мы решили назвать это «Let There Be Blood», таким образом мы хотим отдать дань уважения Полу Бэйлоффу и показать насколько актуальными являются эти песни сейчас, которые мы с ним сочинили тогда. Мы не хотим заменить оригинал, это невозможно. Мы просто отдаём эти песни в пользу современного искусства. Это то, о чём мы говорили до смерти Пола, и это всегда было важно для нас. Мы были очень рады войти в студию, чтобы снова записать эту классику, и сейчас мы возвращаемся, чтобы сделать следующую студийную запись!"
Альбом Exhibit B: The Human Condition был записан в северной Калифорнии с участием продюсера Энди Снипа (с которым группа выпустила последние 4 работы) и вышел в мае 2010 года на Nuclear Blast. Группа отправляется в тур с Megadeth и Testament. С 2011 Гэри Холту приходится заменить Джеффа Ханнемана в Slayer, так как у того начал развиваться некротический фасциит из-за укуса паука. Его место в Exodus временно занимает Рик Ханолт (покинувший группу в 2005 году).
4 февраля 2012 проходит концерт памяти Пола Бэйлоффа, в котором приняли участие бывшие и нынешние участники группы, в том числе Кирк Хэмметт, Рик Ханолт и Джефф Эндрюс, не игравшие вместе с 1983 года.
Летом 2012 года группа начала работу над написанием материала для своего десятого студийного альбома, а 27 марта 2014 года было объявлено, что музыканты приступили к записи.
9 июня 2014 года на своём сайте Exodus объявили о возвращении Стива Сузы, который заменил Роба Дьюкса, находившегося в команде девять лет.
Релиз нового альбома, получившего название Blood In, Blood Out, состоялся 14 октября 2014 года на Nuclear Blast.
